Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sec22bO08547 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms