Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms