Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms