Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm20918J3QN17 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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