Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms