Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Taf4bG5E8Z2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Taf4bG5E8Z2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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