Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syngap1F6SEU4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms