Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ddx60E9PZQ1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ddx60E9PZQ1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ddx60E9PZQ1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ddx60E9PZQ1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ddx60E9PZQ1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ddx60E9PZQ1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx60E9PZQ1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ddx60E9PZQ1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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