Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms