Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Samd1D3YXK1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Samd1D3YXK1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Samd1D3YXK1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms