Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cttnbp2B9EJA2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms