Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pnldc1B2RXZ1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pnldc1B2RXZ1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pnldc1B2RXZ1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pnldc1B2RXZ1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms