Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Trabd2bB1ATG9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Trabd2bB1ATG9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trabd2bB1ATG9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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