Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem238A9JSM3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms