Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
H2-M5A7VMS3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms