Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rtf1A2AQ19 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rtf1A2AQ19 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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