Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pramef6A2A8M8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pramef6A2A8M8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pramef6A2A8M8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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