Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Hivep3A2A884 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms