Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms