Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms