Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn7Q9Z261 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms