Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema6cQ9WTM3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms