Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Psmb3Q9R1P1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Psmb3Q9R1P1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms