Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Limd1Q9QXD8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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