Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc97Q9DBT3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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