Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pdzd9Q9D9M4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms