Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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