Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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