Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Cldn23Q9D7D7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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