Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lonrf3Q9D4H7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lonrf3Q9D4H7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms