Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UvssaQ9D479 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UvssaQ9D479 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms