Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stag1Q9D3E6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stag1Q9D3E6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms