Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tspan11Q9D1D1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms