Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap57Q9D180 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap57Q9D180 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap57Q9D180 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap57Q9D180 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cfap57Q9D180 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cfap57Q9D180 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms