Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed3Q9D0L1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zbed3Q9D0L1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zbed3Q9D0L1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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