Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms