Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms