Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shisa9Q9CZN4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms