Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp2Q9CYZ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp2Q9CYZ8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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