Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ndufa3Q9CQ91 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms