Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms