Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Npm3Q9CPP0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms