Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Smim3Q99PE5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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