Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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