Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RtcbQ99LF4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms