Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms