Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2P6

Rfesd, Rieske domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfesdQ8K2P6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfesdQ8K2P6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms