Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11fip3Q8CHD8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rab11fip3Q8CHD8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rab11fip3Q8CHD8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rab11fip3Q8CHD8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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