Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm28Q8CGC6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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