Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms